潔凈空調與一般空調的區(qū)別主要表現(xiàn)在口下幾個方面：
(1)要參數控制
一般空側重溫度、度、新空氣量和聲制，而潔凈則側重控制室內空氣的含塵量、風速和換氣次數，在溫、濕度有要求的房間，溫、濕度也是主要控制參數。對生物潔凈室，含菌量是主要的制參數之一。
(2)空氣過濾手段
一般空調有的只有粗效一過油，要求高的是鐵，中效兩級過濾處理。而潔凈空調則要求粗、中、高效三級過濾或粗、中，亞高效三級過濾，同時，為了消除室內排風對大氣環(huán)境的影響，需依據不同的情況在排風系使設排風過濾或排風凈化處理。
(3)室內壓力要求
一般空調對室內壓力要求不嚴，而潔凈空調為了外界四染空氣的滲入(內部污染物逸出)或不同活凈室(區(qū))不同物質的相互影響，對不同潔凈室(區(qū))的壓差均有不同的要求。
(4)避免外界污染
為了避免被外界污染，潔凈空調系統(tǒng)材料和設備的選擇、加工工藝、加工安裝環(huán)境、設備部件的儲存環(huán)境等，均有特殊要求。
(5)對氣密性的要求
雖然一般空調系統(tǒng)對系統(tǒng)的氣密性、滲氣量有一定的要求，但潔凈空調系統(tǒng)的要求要比一般空調系統(tǒng)嚴得多，其檢測手段、各工序的標準均有嚴格措施及測試要求。
(6)對土建及其他工種的要求
一般空調房間對建筑布局、熱工等有要求，但選材要求不是很嚴格。而潔凈空調對建筑質量的評價除一般建筑的外觀等要求外，還對防塵、防起塵、防滲漏有嚴格要求。在施工工序安排及搭接上要求嚴格，以避免產生裂縫造成滲漏，潔凈空調系統(tǒng)對其他工種的配合要求也很嚴格，主要集中在防滲漏，避免外部污染空氣人潔凈室及防止積塵對潔凈室的污染。
